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University of Tsukuba, Laboratory of Fungal Interaction and Molecular Biology

業績(講座開設以降)PUBLICATIONS

代表的論文リスト

  1. Takahashi H et al, Interspecies genomic variation and transcriptional activeness of secondary metabolism-related genes in Aspergillus section Fumigati. Front. Fungal Biol. (2021)

    糸状菌二次代謝の多様性や、休眠二次代謝の謎に迫ることを目指し、病原菌Aspergillus fumigatusとその近縁種の計9種を対象に、二次代謝遺伝子に焦点を当てた比較ゲノム解析と、異なる4種の培養条件でトランスクリプトーム解析を実施した。比較ゲノム解析により、種間で保存性の高い生合成遺伝子クラスターとユニークな生合成遺伝子クラスターを提示した。種間で良く保存された生合成遺伝子ほど発現する傾向にあることを示し、種にユニークな生合成遺伝子は「休眠二次代謝遺伝子」になりやすいことが示唆された。


  2. Chiba Y et al, Discovery of divided RdRp sequences and a hitherto unknown genomic complexity in fungal viruses. Virus Evol. (2020)

    菌類RNAウイルスのゲノム構造の多様性や進化に関して議論することを目的とし、病原菌Aspergillus fumigatusとその近縁種の計155株を対象に、網羅的なマイコウイルス探索を実施した。解像度が高く精細な配列情報を取得できるFLDS法により12種19株のウイルスゲノムを決定し、新種とされるウイルスが複数見出された。中でも、ウイルスゲノム複製酵素をコードするRdRp遺伝子が、異なる2つのORFに分割されたゲノムを持つ新奇なウイルスの存在を明らかにした。植物病原糸状菌にも同様の分割型RdRpを持つマイコウイルスが感染していることを示し、このタイプの菌類ウイルスが一定数存在することが示唆された。


  3. Ninomiya A et al, Mycovirus-induced tenuazonic acid production in a rice blast fungus Magnaporthe oryzae. Front. Microbiol. (2020)

    菌類ウイルスが糸状菌の二次代謝に与える影響を明らかにするため、3種のウイルスが感染したイネいもち病菌Magnaporthe oryzaeとこのうち2種のウイルスが除去された株の培養液を比較した。その結果、ウイルス依存的なテヌアゾン酸の産生が見出された。再感染実験により、Totivirusが本化合物の産生を正に制御していることが明らかになった。またRT-qPCR解析から、生合成遺伝子TAS1および転写因子TAS2の活性化により化合物生産が誘導されることが示唆された。ウイルスによる糸状菌二次代謝の調節を、遺伝子レベルで初めて明らかにした。


  4. Hagiwara D, Isolation of azole-resistant Aspergillus fumigatus from imported plant bulbs in Japan and the effect of fungicide treatment. J. Pest. Sci. (2020)

    アゾール耐性を示す病原菌Aspergillus fumigatusが、世界中に広がりを見せ近年問題となっている。植物球根に付着し輸出入による拡散が一因として挙げられており、本邦における実態を調査した。2018-2019年に購入したチューリップ球根からA. fumigatusが一定数分離され、>10%の球根からアゾール耐性株が分離された。続いて、慣行的な方法で登録農薬による浸漬処理を行ったところ、アゾール耐性株の分離頻度が低下したことから、農薬処理が一定の効果を示すことが明らかになった。


論文

  1. Hirai M, Takaki Y*, Kondo F, Horie M, Urayama S, Nunoura T. RNA viral metagenome analysis from subnanogram dsRNA using fragmented and primer ligated dsRNA sequencing (FLDS). Microbes and Environments, Accepted.

  2. Takahashi H, Umemura M, Ninomiya A, Kusuya Y, Shimizu M, Urayama S, Watanabe A, Kamei K, Yaguchi T, Hagiwara D*. Interspecies Genomic Variation and Transcriptional Activeness of Secondary Metabolism-Related Genes in Aspergillus Section Fumigati. Frontiers in Fungal Biology, 2: 656751. doi: 10.3389/ffunb.2021.656751 (2021)

  3. Uehara-Ichiki T*, Urayama S, Hirai M, Takaki Y, Nunoura T, Fujinaga M, Hanada K. Complete genome sequence of Sikte (Sitke) waterborne virus, a member of the genus Tombusvirus. Archives of Virology, 166: 991-994 (2021)

  4. Fujita R*, Inoue M, Takamatsu T, Arai H, Nishino M, Abe N, Itokawa K, Nakai M, Urayama S, Chiba Y, Amoa-Bosompem M, Kunimi Y. Late Male-Killing Viruses in Homona magnanima Identified as Osugoroshi Viruses, Novel Members of Partitiviridae. Frontiers in microbiology, 11: 3558 (2021)

  5. Chiba Y, Oiki S, Yaguchi T, Urayama S*, Hagiwara D*. Discovery of divided RdRp sequences and a hitherto unknown genomic complexity in fungal viruses. Virus Evol. 7(1), veaa101 (2020) (プレスリリース

  6. Tani S*, Nishio N, Kai K, Hagiwara D, Ogata Y, Tojo M, Sumitani JI, Judelson HS, Kawaguchi T. Chemical genetic approach using beta-rubromycin reveals that a RIO kinase-like protein is involved in morphological development in Phytophthora infestans. Sci. Rep. 10: 22326 (2020)

  7. Takahashi-Nakaguchi A* , Shishido E, Yahara M, Urayama S, Ninomiya A, Chiba Y, Sakai K, Hagiwara D, Chibana H, Moriyama H, Gonoi T. Phenotypic and molecular biological analysis of polymycovirus AfuPmV-1M from Aspergillus fumigatus: Reduced fungal virulence in a mouse infection model. Front. Microbiol. 11: 607795 (2020)

  8. Abeysinghe G, Kuchira M, Kudo G, Masuo S, Ninomiya A, Takahashi K, Utada A, Hagiwara D, Nomura N, Takaya N, Obana N*, Takeshita N*. Fungal mycelia and bacterial thiamine establish a mutualistic growth mechanism. Life Science Alliance, e202000878 (2020)(プレスリリース)(Science誌のEditors’ Choice

  9. Urayama S*, Doi N, Kondo F, Chiba Y, Takaki Y, Hirai M, Minegishi Y, Hagiwara D, Nunoura T. Diverged and active partitiviruses in lichen. Front. Microbiol. 11: 561344 (2020)

  10. Morishita Y, Aoki Y, Ito M, Hagiwara D, Torimaru K, Morita D, Kuroda T, Fukano H, Hoshino Y, Suzuki M, Taniguchi T, Mori K, Asai T*. Genome mining-based discovery of fungal macrolides modified by GPI-ethanolamine phosphate transferase homologs. Org. Lett., 22: 5876-5879 (2020)

  11. Ninomiya A, Urayama S, Suo R, Itoi S, Fuji S, Moriyama H, Hagiwara D*. Mycovirus-induced tenuazonic acid production in a rice blast fungus Magnaporthe oryzae. Front. Microbiol. 11: 1641 (2020)

  12. Hagiwara D*. Isolation of azole-resistant Aspergillus fumigatus from imported plant bulbs in Japan and the effect of fungicide treatment. J. Pest. Sci., 45: 147-150 (2020)
    (早期公開)
    https://www.jstage.jst.go.jp/article/jpestics/advpub/0/advpub_D20-017/_article/-char/ja

  13. Chiba Y, Tomaru Y, Shimabukuro H, Kimura K, Hirai M, Takaki Y, Hagiwara D, Nunoura T, Urayama S *. Viral RNA genomes identified from marine macroalgae and a diatom. Microbes and Environments, 35(3): ME10016 (2020)

  14. Kadoya S, Urayama S, Nunoura T, Hirai M, Takaki Y, Kitajima M, Nakagomi T, Nakagomi O, Okabe S, Nishimura O, Sano D. Bottleneck Size-Dependent Changes in the Genetic Diversity and Specific Growth Rate of a Rotavirus A Strain. Journal of Virology 94:e02083-19 (2020)

  15. Urayama S*, Takaki Y, Hagiwara D, Nunoura T. dsRNA-seq reveals novel RNA virus and virus-like complete genome sequences from Hymeniacidon sp. sponge. Microbes and Environments. 35(2), ME19132 (2020)

  16. Rocha M, Fabri J, Simões I, Silva-Rocha R, Hagiwara D, Cunha A, Goldman G, Cánovas D, and Malavazi I*. The cell wall integrity pathway contributes to the early stages of Aspergillus fumigatus asexual development. Appl. Environ. Microbiol., 86: e02347-19 (2020)

  17. Takahashi-Nakaguchi A, Shishido E, Yahara M, Urayama S, Sakai K, Chibana H, Kamei K, Moriyama H, Gonoi T. Analysis of an intrinsic mycovirus associated with reduced virulence of the human pathogenic fungus Aspergillus fumigatus. Frontiers in Microbiology, 10:3045. doi: 10.3389/fmicb.2019.03045. (2020)

  18. Sugahara A, Yoshimi A, Shoji F, Fujioka T, Kawai K, Umeyama H, Komatsu K, Enomoto M, Kuwahara S, Hagiwara D, Katayama T, Horiuchi H, Miyazawa K, Nakayama M, Abe K*: A Novel Antifungal Compound Z-705 Specifically Inhibits Protein Kinase C of Filamentous Fungi. Appl. Environ. Microbiol., 85:e02923-18 (2019) doi: 10.1128/AEM.02923-18.

  19. Paul S, Stamnes M, Thomas G, Liu H, Hagiwara D, Gomi K, Filler S, Moye-Rowley WS*: AtrR is an essential determinant of azole resistance in Aspergillus fumigatus. mBio, 10: e02563-18 (2019)

  20. José de Assis L, Manfiolli A, Mattos E, Malavazi I, Jacobsen ID, Brock M, Cramer RA, Thammahong A, Hagiwara D, Ries LNA, Goldman GH*: Cooperation between protein kinase A (PKA) and high osmolarity glycerol (HOG) response pathways cooperatively control cell wall carbohydrate mobilization in Aspergillus fumigatus. mBio, 9: e01952-18 (2018)

  21. Hagiwara D, Arai T, Takahashi H, Kusuya Y, Watanabe A*, Kamei K: Non-cyp51A azole-resistant Aspergillus fumigatus isolates with mutation in HMG-CoA reductase. Emerg. Infect. Dis., 24: 1889-1897 (2018)

  22. Hagiwara D*, Takahashi H, Takagi H, Watanabe A, Kamei K: Heterogeneity in pathogenicity-related properties and stress tolerance in Aspergillus fumigatus clinical isolates. Med. Mycol. J., 59E: E63-E70 (2018)

  23. Urayama S*, Takaki Y, Nishi S, Yoshida-Takashima Y, Deguchi S, Takai K, Nunoura T. Unveiling the RNA virosphere associated with marine microorganisms. Molecular Ecology Resources, 18:1444-1455, (2018) (Open Access)

総説・解説

  1. 浦山俊一. 「天然のウイルスを使った微生物の”調和的”な活性化」. 生物工学会誌, 98, 680頁. 2020年

  2. 萩原大祐:「アスペルギルス属菌:国民的 fungal group」, 生物工学会誌, 98(8), 434 (2020)

  3. 萩原大祐: 「微生物、非純粋培養のすすめ」, 生物工学会誌, 98, 192 (2020)

  4. 浦山俊一千葉悠斗、高木善弘、萩原大祐、布浦拓郎、「再構築された”ウイルス生態像”」バイオテクノロジー学会、19, 5-12 (2019)

  5. 浦山俊一ネオウイルス学 Newsletter No.04

  6. 浦山俊一・布浦拓郎. 「ウイルス”再発見”-海水から探るその新たな生存戦略」. academist journal. 研究コラム. 2018年.

  7. Hagiwara D*: Current status of azole-resistant Aspergillus fumigatus isolates in East Asia: China, Japan, Korea, and Taiwan. Med. Mycol. J., 59E: E71-E76 (2018)

  8. Toyotome T*, Hagiwara D, Takahashi H, Watanabe A, Kamei K: Emerging antifungal drug resistance in Aspergillus fumigatus and among other species of Aspergillus. Curr. Fungal Infect. Rep., 12: 1-7 (2018)

  9. 萩原大祐、「糸状菌ゲノムから紐解く二次代謝の多様性」JSM Mycotoxins, 68(2):89-92 (2018)

  10. 萩原大祐、「真菌の薬剤耐性機序」化学療法の領域 増刊号「深在性真菌症のすべて」,34(S-1):37-45 (2018)

  11. 浦山俊一・布浦拓郎. 「変化する“ウイルス像” 生物と共栄するウイルス」. バイオサイエンスとインダストリー. 76巻, 3号. 228-230頁. 2018年.

Grant

  1. 2021-2023年度 科研費:若手研究(代表:老木)
    「植物由来精油成分ファルネソールに対する糸状菌の応答分子機構」

  2. 2021-2023年度 特別研究員奨励費(PD)(代表:老木)
    「ファルネソールを介した糸状菌と微生物叢との相互応答」

  3. 2021-2023年度 特別研究員奨励費(PD)(代表:二宮)
    「菌類ウイルスが非自然宿主の二次代謝に与える影響の解明」

  4. 2020-2022年度 JST ACT-X [環境とバイオテクノロジー](代表:二宮)
    「ウイルスゲノムを利用した糸状菌の二次代謝機能開発」

  5. 2020〜2023年度(分担:浦山)(代表:福原崇介)
    新興・再興感染症研究基盤創生事業 多分野融合研究領域
    「病態進展に関与するウイルス叢の性状および進化機構の解明」

  6. 2020〜2022年度 科研費:基盤研究(C)(代表:浦山)
    「麹菌が産生する細胞外膜小胞の解析―分泌酵素との関係を探る―」

  7. 2020〜2022年度 科研費:新学術領域研究(研究領域提案型)(代表:浦山)
    「生態系構成因子としての”ウイルス”を独自技術で捉える」

  8. 2019-2020 科研費:研究活動スタート支援(代表:老木)
    「糸状菌を取り巻く生物間相互作用における一酸化窒素の機能解明」

  9. 2018-2019 科研費:研究活動スタート支援(代表:二宮)
    「ウイルス―糸状菌間相互作用に基づく新規生物活性物質の探索」

  10. 2018-2020 科研費:挑戦的研究(開拓)(分担:浦山)(代表:布浦拓郎)
    「非レトロRNAウイルス網羅解析技術による新しいRNAウイルス学の創出」

  11. 2018-2020 科研費:挑戦的研究(萌芽)(分担:浦山)(代表:木村圭)
    「海藻に感染する,新奇「善玉・悪玉」RNAウイルスの探索と機能解明」

  12. 2018-2019 科研費:挑戦的研究(萌芽)(代表:浦山)
    「宿主と“共生的”なウイルス伝播機構の解明」

  13. 2017-2019 J-PRIDE(分担:浦山)(代表:福原崇介)
    「肝移植後の病態と予後に関与するRNAウイルスの探索」

  14. 2017-2023 発酵研究所寄附講座助成(代表:萩原)

  15. 2017-2020 J-PRIDE(分担:萩原)(代表:高橋弘喜)
    「病原真菌Aspergillus fumigatusの環境適応能の数理モデル化による理解とそれに基づく感染防御を目指した研究」

  16. 2016-2019 科研費:若手B(代表:萩原)
    「糸状菌胞子における休眠メカニズムの分子基盤解析」

  17. 2016-2019 科研費:基盤A(分担:萩原)(代表:高木博史)
    「真菌における一酸化窒素の合成制御機構と生理機能の解明」

受賞

2020年度
  1. 池田彩乃、千葉悠斗、浦山俊一、萩原大祐「菌類ウイルスの効率的な治癒株作成法の発見」優秀発表賞(ポスター)、ウイルス学若手研究集会2020、オンライン

  2. 辻晴佳, 二宮章洋, 甲斐建次, 浦山俊一, 萩原大祐「共培養により誘導されるAspergillus nigerの色素生産と生合成遺伝子の解析」優秀発表賞、日本農芸化学会関東支部大会、オンライン

  3. Marina Takata, Moriyuki Kawauchi, Yasuo Onishi, Keishi Seno, Kiminori Shimizu, Syun-ichi Urayama, Daisuke Hagiwara「Study on Aspergillus nidulans in soil culture and teraction between fungi and soil microbiome」Best Poster Award, Tsukuba Global Science Week 2020、 Tsukuba

2019年度
  1. Yuto Chiba, Syun-ich Urayama, Takashi Yaguchi, Daisuke Hagiwara「RNA virus diversity in Aspergillus fumigatus and its related species revealed by deep-sequencing method」Poster Award, The 8th Global Network Forum on Infection and Immunity, Chiba

  2. 岩橋由佳,浦山俊一,桝尾俊介,兼松周作,高谷直樹,野村暢彦,竹下典男,豊福雅典,萩原大祐「Aspergillus属菌における細胞外膜小胞の探索」企業特別賞、第19回糸状菌分子生物学コンファレンス、札幌

  3. 萩原大祐「アスペルギルスフミガタスの薬剤耐性機構及びその制御機構の研究」日本医真菌学会奨励賞

  4. 千葉悠斗、浦山俊一、矢口貴志、萩原大祐「Aspergillus fumigatusとその関連種に潜伏するRNAウイルスの網羅的な探索」優秀演題賞、第40回関東医真菌懇話会、新宿




バナースペース

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